Strukturformel des Chlorophylls

 

Clorophyll a ist das Pigment, das unmittelbar an der lichtabhängigen Reaktion beteiligt ist.
 
 
 Der "Kopf" des Chlorophyllmoleküls ist der entscheidende Teil für die Lichtabsorption. Er besteht aus einem Porphyrinring mit einem zentral angeordneten Magnesiumatom. An den Kopf ist eine Phytolkette gebunden. Das ist ein langkettiger Alkohol. Damit wird das Molekül in der Thylakoidmembran verankert.

Chlorophyll a und b unterscheiden sich nur in einer der funktionellen Gruppen am Porphyrinring. Diese funktionellen Gruppen sind an der Stelle, die mit "R" (für Rest) gekennzeichnet ist, mit dem Porphyrinring verknüpft.